Beslutet ses som mycket förvånande, eftersom Modi tidigare hållit en hård linje mot de protesterande bönderna.
Men valstrategiskt är det vältajmat, eftersom lantbrukstäta delstater som Uttar Pradesh och Punjab, med tillsammans långt över 200 miljoner invånare, snart går till regionval.
– Jag vädjar till alla bönder som har varit en del av protesterna... att nu återvända hem, till era nära och kära, till era gårdar, säger Modi.
Det är flera månader kvar till valen, men Bharatiya Kisan, böndernas intresseorganisation i Uttar Pradesh, klargör att de inte riktigt litar på regeringen.
Läs mer:Upptrissad stämning i Indien sedan bönder och partiföreträdare dödats