Det råder oenighet mellan Coronakommissionen och regeringskansliet kring vilka handlingar som kommissionen ska få ta del av i sitt arbete med att granska Sveriges pandemihantering. Kommissionen har vid flera tillfällen begärt att få ta del av minnesanteckningar, loggböcker och annan dokumentation som gjorts av befattningshavare inom regeringskansliet med koppling till pandemin. De vill också ta del av anteckningar från möten i Krishanteringsrådet, där bland annat statsministerns statssekreterare och företrädare för tunga myndigheter ingår, samt anteckningar från möten i en grupp som kallas GSS, där statssekreterarna som leder krishanteringsarbetet i olika departement deltar.